柑橘在我国种植面积有4800多万亩，年产量达5800多万吨，均居世界首位。“我国目前生产所用品种6成从国外引进。”国家柑橘品种改良中心陈善春研究员介绍，目前，我国柑橘种业面临着自主知识产权品种缺乏、黄龙病和溃疡病等重大危险性病害肆虐，以及多元化柑橘品种需求和品种创制严重滞后等问题。而传统杂交育种周期长、目的性差，选育一个新品种往往要耗费30年以上的时间。
育种芯片是种质资源基因型检测的重要工具，主要用来打造品种唯一的“DNA身份证”。它可快速识别与优良性状相关联的基因或标记，在农作物遗传改良与育种研究中发挥着重要作用。此前我国尚无成熟柑橘基因分型芯片。
西南大学柑桔研究所建立的国家柑橘种质资源圃，是我国最大、全球第二大的柑橘种质资源圃。国家柑橘品种改良中心创制有全国最丰富的杂交和转基因资源材料。团队通过对国家柑橘种质资源圃300多个代表性柑橘种质资源进行深度重测序，筛选出4万余个核心SNP（单核苷酸多态性）位点。同时，他们加入了数千个与柑橘重要性状紧密关联的SNP位点，利用靶向捕获技术，开发出柑橘全基因组40K液相育种芯片。
“育种芯片可以极大地提高育种效率和精确度。”西南大学柑桔研究所李强副教授介绍。
“育种芯片还可以极大地缩短亲本选择配置、子代预选周期。”该所国家柑橘品种改良中心主任何永睿介绍，“橘芯1号”将为开展柑橘生物育种、开发柑橘全基因组选择育种平台奠定基础，有助于设计培育优质、高（多）抗等柑橘新品种，具有巨大应用前景。目前，团队正在用“橘芯1号”加速培育抗黄龙病和溃疡病新品种。
来源：科技日报
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